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Protocolo Digital · Bioinformática de Geles

Densitometría de Proteínas

Guía de Cuantificación Digital con ImageJ / Fiji (Normalización BSA)

🚀 Iniciar ImageJ.JS (Web)
🧪 ¿Vas a preparar tu gel o cargar muestras antes de la densitometría?
Consulta la Bitácora DCQB: Calculadora de geles Laemmli (resolving/stacking), cálculo de masa de carga y protocolo riguroso de fijación en metanol y tinción nocturna (Overnight) con Coomassie R-250.
Ir a Bitácora SDS-PAGE ↗

1. Fundamento

Este protocolo estandariza la transformación de observaciones visuales cualitativas en datos semi-cuantitativos robustos, eliminando la subjetividad del análisis visual.

Versatilidad Experimental

Esta metodología es universal para:

  • 🧪 Tubos de ensayo.
  • 🧫 Placas de Petri.
  • 📸 Western Blots y Geles SDS-PAGE.

2. Mapa del Proceso

📂 Cargar
Imagen
🌑 Escala de
Grises 8-bit
⬜ Definir
Carriles
📈 Generar
Perfiles
📏 Cierre de
Picos
🪄 Medición
de Área

3. Guía Visual: Pre-procesamiento

El software necesita interpretar "brillo" como "cantidad".

1. Cargar

File > Open...

2. Convertir

Image > Type > 8-bit

3. Invertir

Edit > Invert

4. Definición y Análisis de Carriles

⚠️

ACR: ¿Por qué mis gráficos salen delgados o cortados?

Causa: Seleccionar solo la banda pequeña ("el cuadrito") en lugar de definir el contexto del carril.

Solución: La herramienta de selección debe abarcar desde el inicio superior hasta el final inferior del gel verticalmente, cubriendo todo el camino por donde corrió la muestra.

A. Selección Rectangular

Seleccione la herramienta Rectángulo ⬜ en la barra.

Dibuje un rectángulo largo y vertical que encierre TODO el primer carril (desde el pozo hasta el frente).

B. Definir Primer Carril

Con el rectángulo seleccionado sobre la primera muestra, vaya al menú:

Analyze > Gels > Select First Lane

(Alternativa: Tecla Ctrl + 1)

Aparecerá un número "1" dentro del recuadro.

C. Siguientes Carriles

¡No dibuje de nuevo! Mueva el recuadro existente hacia la derecha usando:

🖱️ Arrastrando con el mouse (clic al centro).

⌨️ Usando las Flechas del Teclado ← → (Recomendado para mantener la misma altura).

Una vez posicionado, vaya a:

Analyze > Gels > Select Next Lane

(Alternativa: Ctrl + 2)

D. Generar Gráficos

Cuando todos los carriles estén numerados, finalice el proceso:

Analyze > Gels > Plot Lanes

(Alternativa: Ctrl + 3)

5. Cierre de Picos y Medición

Aísle la señal de la proteína cerrando la base de la "montaña" gráfica.

Esquema de la Técnica

1. Línea Recta (Usuario) 2. Clic Varita

Referencias Bibliográficas (APA 7ª Ed.)

Maestri, A., Ehrenborg, E., Werngren, O., Olin, M., Hagberg, C. E., Pedrelli, M., & Parini, P. (2025). Titration-WB: A methodology for accurate quantitative protein determination overcoming reproducibility errors. PLoS ONE, 20(6), e0325052. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0325052
Rinaldi, A. J. (2025). Protein quantification in SDS‑PAGE gels by densitometry using ImageJ/Fiji (with BSA normalization). Protocols.io. https://dx.doi.org/10.17504/protocols.io.kxygx4yzdl8j/v1